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CRISPR gRNA 設計・オフターゲット評価・活性予測を統合した効率的なガイドRNA選択パイプラインを提供する。

What problem does it solve?

CRISPR の gRNA を設計し、オフターゲットリスクを評価し、活性を予測するための統合パイプラインを提供します。複数の計算ステップを連携させることで、手作業での候補選定を大幅に削減します。

Core Features & Use Cases

• PAM 配列検索と gRNA 候補列挙: PAM パターンを検索し、適切な GC 含量のガイド候補を列挙します。
• オフターゲットスコアリング: CFD/MIT スコアに基づき、潜在的なオフターゲットを評価します。
• 活性予測: CRISPRscan/Rule Set 2 を用いた活性予測を提供します。
• ライブラリ構築: sgRNA ライブラリを遺伝子別に設計・組み立てるパイプラインをサポートします。

Quick Start

対象配列を用いて、内蔵の Python ツールを使って gRNA 候補を生成します。